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基于高通量测序Survey评估测定雷竹基因组大小

杨杰芳 甘然 曾庆南 程平 王海霞

杨杰芳, 甘然, 曾庆南, 程平, 王海霞. 基于高通量测序Survey评估测定雷竹基因组大小[J]. 竹子学报, 2021, 40(2): 37-41.
引用本文: 杨杰芳, 甘然, 曾庆南, 程平, 王海霞. 基于高通量测序Survey评估测定雷竹基因组大小[J]. 竹子学报, 2021, 40(2): 37-41.
YANG Jie-fang, GAN Ran, ZENG Qing-nan, CHENG Ping, WANG Hai-xia. Genome Survey of Phyllostachys violascens ‘Prevernalis’ Based on High-thoughput Squencing[J]. JOURNAL OF BAMBOO RESEARCH, 2021, 40(2): 37-41.
Citation: YANG Jie-fang, GAN Ran, ZENG Qing-nan, CHENG Ping, WANG Hai-xia. Genome Survey of Phyllostachys violascens ‘Prevernalis’ Based on High-thoughput Squencing[J]. JOURNAL OF BAMBOO RESEARCH, 2021, 40(2): 37-41.

基于高通量测序Survey评估测定雷竹基因组大小

基金项目: 

江西省林业科技创新专项(202119)

详细信息
    作者简介:

    杨杰芳,高级工程师,从事林业科学研究及管理研究。

    通讯作者:

    王海霞,研究员,从事竹类资源培育及开发利用研究。E-mail:bamboojx@sohu.com

Genome Survey of Phyllostachys violascens ‘Prevernalis’ Based on High-thoughput Squencing

  • 摘要: 为研究雷竹基因组信息,基于高通量测序,利用Illumina测序平台对雷竹基因组进行了分析,采用K-mer法预测雷竹基因组大、杂合度和重复序列等基因组特征,结果表明:雷竹基因组大小约为1 913 Mb,修正后为1 897 Mb,杂合率为1.7%,重复序列比例为69.38%。
  • [1] 王海霞,李江,程平,等.江西红壤区雷竹笋用林高效经营及竹笋加工技术创新与应用[J].中国科技周刊,2021(1):68-69.
    [2] 娄永峰.雷竹不同变异类型的遗传多样性分析[D].杭州:浙江农林大学,2010.
    [3] 林瀚,王晶晶,黄华星,等.利用流式细胞技术测定和评估金线莲基因组大小[J].福建农林大学学报, 2020,49(6):766-771.
    [4] 段先飞,陈小蝶,熊文波,等.基于流式细胞术和K-mer分析的广金钱草基因组大小估测[J].中药新药与临床药理,2020,31(10):1239-1243.
    [5] 王桂瑶,常延斌,郭建华,等.基于高通量测序的烟草粉螟基因组初步研究[J].烟草科技,2021,54(5):8-13.
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-05-30
  • 网络出版日期:  2021-12-22

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